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1950年中央政府遷移臺灣後，司法院、最高法院及臺灣臺北地方法院於司法大廈內合署辦公；1985年，臺灣臺北地方法院遷出；1992年，最高法院也遷出；1998年7月30日，司法大廈經內政部指定公告為國定古蹟。 司法院公報 司法大廈現為司法院、懲戒法院、臺灣高等法院及臺灣高等檢察署的所在地。 目前兩岸當局之間依據各自憲制互不承認對方的合法性，強調中國大陸或台灣屬於法理上的領土的一部分，但依據現實司法管轄之原因，兩岸法律互不隸屬，在《憲法增修條文》修訂憲法本文後，中國大陸公民並不擁有中華民國的公民權，自由地區人民亦非中國大陸居民。 2005年2月24日，親民黨主席宋楚瑜訪問中國大陸前，與中华民国总统陳水扁進行会晤，雙方達成十項共同結論。
國民大會於八十八 年九月四日三讀通過修正憲法增修條文，其修正程序牴觸上開公開透 明原則，且衡諸當時有效之國民大會議事規則第三十八條第二項規定 ，亦屬有違。 依其議事錄及速記錄之記載，有不待調查即可發現之明 顯瑕疵，國民因而不能知悉國民大會代表如何行使修憲職權，國民大 會代表依憲法第一百三十三條規定或本院釋字第三三一號解釋對選區 選民或所屬政黨所負政治責任之憲法意旨，亦無從貫徹。 此項修憲行 司法院公報 為有明顯重大瑕疵，已違反修憲條文發生效力之基本規範。
司法院公報: 司法院公報第64卷第2期(111/
关于中国中央电视台的电视节目，请见「海峡两岸 (电视节目)」。 2018年5月9日，同婚法案協商時，林昶佐向司法院提問，若最後通過的不是政院版「同性婚姻」條款，而是賴士葆、林岱樺版本的非「婚姻」權益，因為不符合釋字748號解釋要求賦與同性婚姻自由的權利。 那麼同志是否仍可在5月24日以後，依照釋憲第748號的結果前往戶政機關登記結婚？ 民進黨團總召柯建銘聽聞後，要求應該於下次協商時，由司法院說明清楚。
被判決解散的政黨應即停止一切活動，而該黨於各級民意機關因政黨比例方式分配產生的民意代表席次，資格立即喪失，對於憲法法庭及審查庭的裁判不得聲明不服。 2000年3月24日，司法院大法官會議做出釋字第四九九號解釋，宣告國民大會於1999年9月4日表決通過並經總統於9月15日公布施行的憲法增修條文（第五次修憲）違憲，即日起失其效力，第四次修憲的規定繼續適用。 美國於1972年承認中華人民共和國後，中華民國的外交關係為此大受打擊，至1976年與中華民國政府維持邦交的國家計23國，其餘世界各國多轉向承認中華人民共和國，包括1972年與中華人民共和國建交的英国、日本及1979年的美國。 隨後1973年5月中華人民共和國與美國正式在對方首都設立聯絡辦事處。 司法院公報 中華人民共和國與美國間的實質外交關係日漸增強、中華民國與美國間的實質外交層次則逐漸降低，終於在1979年1月1日美國與中華人民共和國簽署中美建交公報，斷絕與中華民國的外交關係。
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2020年5月19日，林昶佐邀集跨黨派委員共同提出「開放國會行動方案」決議案，將促進立法院的資訊更公開透明，讓人民更能參與立院議事並監督立委，同時也將推動與78國組成的國際組織「開放政府夥伴聯盟」的「開放國會」更多交流，促進國會外交。 2020年6月2日，立法院宣布動開放國會行動方案，並由林昶佐擔任召集人。 2021年3月9日，經過「開放國會委員會OP-MSF」共24席成員長達半年的努力，立法院宣布公布開放國會行動方案。
大法官資格按《司法院組織法》第四條之規定，應具有下列資格之一具有前項任何一款資格之大法官，其人數不得超過總名額三分之一。 2000年4月25日，總統公布憲法增修條文（第六次修憲），將司法院大法官的同意任命權改由立法院行使，而大法官除由法官轉任者外，不適用憲法保障的終身職待遇。 林昶佐質詢時指出，倘若護照封面上貼貼紙，會造成護照真偽的問題，那是否也要修法規範外國人來台入境時，如果護照上有貼紙，也應被我國政府約談或是遣返？
司法院公報: 司法影音
2021年3月16日，林昶佐與無黨籍台北市議員林亮君今指出，台北市政府錯誤的「老殘分流」政策，剝奪了身心障礙的長者應該有的權益，甚至還需要遷戶籍到其他縣市領取應有的補助，而在衛福部透過函釋宣告北市府此政策違法後，應盡速修法、編列預算，還給身心障礙者應有權益。 2017年1月，林昶佐赴美參與川普就職典禮台灣代表團，表達期盼台美外交的正常化能推進，加深雙邊理解與合作，也表示希望在川普任內，性別平等、反族群歧視、環保、社會正義…等價值能不要倒退。 並接受美國VOA衛視專訪，認為在國際的棋局中，台灣應有自主性，做「自己會動的棋子」。
最終根據台北市選舉委員會公告投票結果，總投票數為98549票（投票人總數為235024人，總投票率約41.93%），其中同意票為54813票、不同意票為43340票、廢票為396票。 司法院公報 雖然同意票較多，但因同意票數未達同意罷免門檻（有效同意票多於不同意票數、且同意票數達選區選舉人總數25%以上才成立）的58756票，本次罷免案罷免投票並未通過。 2018年6月6日，林昶佐肯定外交部、移民署及陸委會讓中國大陆維權人士黃燕來台短暫安置，彰顯台灣「自由民主與人道精神」。 同時也呼籲應推進「難民法」的制定，提供受迫害的人們更健全的庇護。 樹黨4,5062.70%選舉人數248,868投票數170,046有效票166,895無效票3,151投票率68.33%2016年第九屆立法委員選舉，林昶佐在臺北市第五選舉區當選中華民國第九屆立法委員。
司法院公報: 政治觀點
进入21世纪后，海峽兩岸经济关系已相當緊密，但政治關係仍停滯不前。 2015年11月，海峽兩岸最高領導人馬英九、習近平在新加坡會面，被视为兩岸关系史上的重大突破。 但自2016年蔡英文执政以来，蔡不承認九二共識，而中華人民共和國政府仍堅持兩岸同屬一個中國，因此两岸交流再次減少。 司法院公報 依據《中華民國憲法》為中華民國最高司法機關，掌理民事、刑事、行政訴訟的審判及公務員的懲戒，並設有大法官十五人，組成憲法法庭審理違反憲法案件、統一解釋法令及總統、副總統彈劾案與政黨違憲解散案。 司法院並不職司審判權，而是由轄下的各級法院、行政法院及懲戒法院實行該權力，院本身主掌司法行政及司法預算。
2018年1月12日，林昶佐認為《勞動基準法》修正後所新增的32-1條規定加班換補休期限「由勞雇雙方協商」，同一條又僅限定「補休期限屆期」或「離職」時，若仍未補休完畢才需給付加班費。 意味著可能導致勞工拿不到加班費又沒有補休，這是很嚴重的漏洞，行政院應自行提出覆議。 2021年6月18日，攸關台灣疫情破口的立法院第10屆第3會期426號提案公布機組人員3+11檢疫政策決策過程的議案中，投下反對票，同意政府不需要公開決策過程，引起議論。 2017年3月1日，立法院針對《都市危險及老舊建築物加速重建獎勵條例草案》進行審議，林昶佐質詢時以中正萬華的老屋為例，要求內政部訂定草案應聽進在地的聲音，「讓這個政策的推動，真的符合人民的需要，解決老社區的問題。」要求應該重視老社區狹小巷弄，以及防災避難空間、警消、醫療、交通動線原本就可能有不足的問題。 祖母是苗栗客家人，4歲開始學習鋼琴，小學與中學時期，參加學校合唱團擔任鋼琴伴奏。 初中就讀於台北市懷生國中，畢業後考進延平高中，在高中老師建議之下開始閱讀玉山社和前衛出版社等關於台灣文化和黨外運動的書籍後，而所以認同台灣本土理念支持台灣獨立。
司法院公報: 行政
一边一国台湾（中华民国是台湾）、中国（中华人民共和国），一边一国，也称一中一台。 一國兩制「一個國家，兩種制度」，由中共第二代領導人鄧小平針對統一臺灣提出，容許臺灣保留資本主義經濟、社會秩序、獨立的政治制度、司法體制和軍隊，而中華人民共和國政府治下的中國大陸則繼續實行中國特色社會主義經濟以及民主集中制，但是在外交上只容許中华人民共和国為中國唯一合法政府。 一國兩府「一個國家，兩個政府」，兩岸皆屬同一個中國，但包含中华民国政府和中华人民共和国政府兩個政治實體。 一国两区「一国」指的是中華民國，「兩區」指的是大陸地區和臺灣地區，2012年由中國國民黨馬英九提出，對於臺灣海峽兩岸關係的一個定位。 台湾独立在台灣終結現有中華民國政治體制，宣布獨立，建立以“台灣”为主體的國家，制定新憲法。
111年12月21日監察委員趙永清、葉大華及蘇麗瓊，針對恩恩罹患新冠肺炎緊急送醫案，提出調查報告，並糾正衛生福利部與新北市政府。 司法院公報 111年12月21日監察委員陳景峻及浦忠成，針對花蓮縣環保科技園區附近國有農地遭違法掩埋大量廚餘案，提出調查報告，並糾正花蓮縣政府。 111年12月15日監察委員范巽綠，針對綠島人權文化園區文化景觀管理及維運是否妥適等情案，提出調查報告，請文化部及交通部督導所屬檢討改進。 111年12月15日監察委員王美玉及鴻義章，針對臺東縣偏遠地區學校師資聘用不足等情案，提出調查報告，請教育部與臺東縣政府確實檢討改進。
司法院公報: 臨時政府時期
針對2018年中華民國地方公職人員選舉，台獨聯盟主席陳南天推舉林昶佐是臺北市長候選人的優秀人選。 針對是否選台北市長，林昶佐並未正面回應，強調不論做什麼事情，都會全力以赴，現在就是做好立委的工作。 最後林昶佐並未參選，只在市長選舉中與現任市長柯文哲保持相對良好的關係。
並與代表「中國」的中華民國代表當面對質，譴責其「辜负违背了中国人民的意愿，他没有任何权利代表中国。这个发言的人可能不是中国人，因为伟大的四億七千五百万中国人民的语言，他都不会讲」（當时中華民國代表在聯合國使用的語言是英式英語）。 中華民國代表則指稱聯合國的「中國」席位只能屬於「自由獨立神聖的中國政府」。 這是中華人民共和國首次出席聯合國會議，也是海峽兩岸雙方唯一一次當面外交對質。 在朝鮮戰爭結束後的1954年日內瓦會議上，中華人民共和國更是派出了其外交部長周恩來出席會議，成為中華人民共和國首次出席的重大國際會議。 1955年，聯合國秘書長哈馬捨爾德訪問北京，成為首位訪問中華人民共和國的國際組織領導人。
司法院公報: 政治生涯
另外在省虛級化後，司法院是臺灣唯三僅存設置「廳」的機關（其餘為最高法院、審計部）。 福建省政府由於轄區自1956年後長期施行戰地政務，省政府組織早已虛級化；臺灣省政府早期實際負責地方自治工作、綜理全省事務，省主席具有實權，後更於1994年選出首任民選省長。 然而，由於臺灣省與中華民國實際管轄區域長期高度重疊，中華民國政府為精簡事務運作，於1998年實施省虛級化政策，使臺灣省政府組織大幅精簡；原由其負責之政務，也盡數轉由行政院及各區域聯合服務中心承擔。 司法院公報 根據目前的《地方自治法》規定，省政府仍具有公法人身分，但成為行政院的派出機關，政策制定與人事任命權均由中央掌握；省議會則改制為省諮議會，成為諮詢機關，失去原有立法機關的功能。 至於原屬省政府管轄的縣、市等地方各級政府則改由中央政府直接管轄，並以內政部為主要監理機關，各縣、市僅在行政區劃上仍隸屬於省。 2018年，時任行政院院長賴清德進一步決議省級機關去任務化、預算歸零，所存省級行政組織及業務完全移交中央政府。
- 关于中国中央电视台的电视节目，请见「海峡两岸 (电视节目)」。
- 中華民國憲法中規定司法院院長、副院長由總統提名，經監察院同意任命。
- 2022年12月8日，农业委员会主任委员陈吉仲表示，中国没有准许台湾超过百家公司对其出口销售鱼类产品，如鱿鱼、秋刀鱼、午仔鱼等。
- 2020年5月19日，林昶佐邀集跨黨派委員共同提出「開放國會行動方案」決議案，將促進立法院的資訊更公開透明，讓人民更能參與立院議事並監督立委，同時也將推動與78國組成的國際組織「開放政府夥伴聯盟」的「開放國會」更多交流，促進國會外交。
- 2015年11月7日，两岸领导人在新加坡會面，是為兩岸關係的重大進展。
- 在貿易政策方面，2014年台灣爆發了反對兩岸服務貿易協定的太陽花學運，反對海峽兩岸依據《海峽兩岸經濟合作架構協議》（簡稱ECFA）第四條所簽署的服務貿易協定。
- 1950年中央政府遷移臺灣後，司法院、最高法院及臺灣臺北地方法院於司法大廈內合署辦公；1985年，臺灣臺北地方法院遷出；1992年，最高法院也遷出；1998年7月30日，司法大廈經內政部指定公告為國定古蹟。
§5Ⅰ：司法院設大法官十五人，並以其中一人為院長、一人為副院長，由總統提名，經立法院同意任命之，自中華民國九十二年起實施，不適用憲法第七十九條之規定。 司法院大法官除法官轉任者外，不適用憲法第八十一條及有關法官終身職待遇之規定。 §5Ⅱ：司法院大法官任期八年，不分屆次，個別計算，並不得連任。 §5Ⅲ：中華民國九十二年總統提名之大法官，其中八位大法官，含院長、副院長，任期四年，其餘大法官任期為八年，不適用前項任期之規定。 §5Ⅳ：司法院大法官，除依憲法第七十八條之規定外，並組成憲法法庭審理總統、副總統之彈劾及政黨違憲之解散事項。
